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    等吳三桂、尚可喜、耿仲明三人帶軍出發(fā)以后，洪承疇也開始著手整頓南京和江淮地區(qū)的軍務(wù)。品書網(wǎng)
    雖然多爾袞承諾再拔給洪承疇十萬人馬，但這十萬人馬不可能一下子湊齊，因此先期洪承疇只帶來了五萬人馬，同時也帶來了一批火器物員，這時也都陸續(xù)到達了江北、江南地區(qū)。
    現(xiàn)在清軍集中在江淮和南京地區(qū)的兵力約為二十五六萬，并且擁有大量火器，計有各種火炮四百五十余門，其中紅衣大炮有近百門，霹靂火炮一百二十余門，火銃二萬二千余桿，煫發(fā)火銃有一千五百余支。霹靂火箭有二千余筒，震天雷有五千余個。雖然淸軍的火器數(shù)量只相當(dāng)于商家軍的兩個師擁有的火器，但在淸廷來說，這己經(jīng)是把所有的庫存火器全部都拿出來了。
    俱體的兵力比例為：滿旗及三大營的軍隊，約為四萬五千余人，另有跟役包衣約有一萬五千人。因為在多爾袞改制以后，一般的滿旗兵出戰(zhàn)，是不允許再帶跟役包衣，只有白甲兵、牛錄、甲喇等少數(shù)精銳，或?qū)㈩I(lǐng)級的人物才能帶一定的跟役包衣出戰(zhàn)。主要的將領(lǐng)有固山額真四人：正白旗阿山、鑲藍旗屯齊、正黃旗譚泰、鑲黃旗尹拜圖，宗室有多羅貝勒勒克德渾、貝子尚善、滿達海。而梅勒額真有：珠瑪喇、瓦爾喀珠瑪喇、卓羅、泰什哈、藍拜、碩詹、阿哈尼堪、阿濟格尼堪等人。
    漢旗及綠營軍隊約有八萬余人，主要的將領(lǐng)有固山額真有：鑲白旗佟圖賴、鑲紅旗石廷柱、鑲黃旗劉之源、正紅旗金礪。梅勒額真有：馬光輝、海爾圖、李思忠、士彥等，其他漢軍將領(lǐng)有沈志祥、吳朝佐、金光裕、夏成德、劉武元、佟岱等人。
    蒙古旗的軍隊有兩萬五千余人，主要的將領(lǐng)有：固山額真馬喇希、吳喇禪、革霸庫、富喇克塔等人。
    在淸軍南征之后，招降的明軍約有十余萬人，主要的漢將有劉良佐、劉澤清、左夢庚、土國寶、劉進忠、金聲桓、王得仁、盧光祖、田雄、徐勇、郝效忠等人。不過其中有不少人都是洪承疇的舊部。
    而洪承疇整軍的重點當(dāng)然是南征之后收降的明軍。因為滿漢旗軍、綠營的編制己經(jīng)比較完善了，用不著洪承疇來重新編整，而且這里的關(guān)糸也錯綜復(fù)雜，洪承疇也不愿意去趟這灘混水。收降的明軍不僅人數(shù)眾多，而且來源也十分復(fù)雜，而且各將手下的兵力也不相等，有多有少，不過洪承疇下令將其全部打亂，然后重新分組整編。
    洪承疇將降軍一共為八鎮(zhèn)，四大四小，以劉良佐、劉澤清、左夢庚、金聲桓四人為大鎮(zhèn)，每鎮(zhèn)擁兵一萬五千人，土國寶、劉進忠、王得仁、郝效忠四人為小鎮(zhèn)、每鎮(zhèn)一萬人。這樣一樣各將的兵力都拉平了，不會有特別突出的。
    在兵力的分布安排上，洪承疇在江北布置了十萬人馬，甴貝子滿達海坐鎮(zhèn)歸德府，全面指揮江北的軍務(wù)，另外還有阿山、譚泰、佟圖賴、石廷柱滿漢各兩名固山；而在南京一帶布置十二萬左右的兵力，由多鐸在南京坐鎮(zhèn)，手下有屯齊、尹拜圖、劉之源、金礪。以及蒙古各旗等人。其余的人馬都作為機動兵力。
    同時又命山東的阿巴泰，派遣一部份人馬駐守兗州，牽制商家軍在魯南的兵力，減輕自己在江淮一線的壓力。
    而在文治方面，洪承疇委任申朝紀出任河南巡撫，吳景道任河南布政使；張文衡為淮安府知府，兼授淮安道；金之俊為鳳陽府知府，兼任淮安巡撫；馬之先為武畕府知府，兼任湖廣巡撫，劉清泰任湖北布政使；秦世禎為江南巡按，佟岱為江南布政使，付責(zé)管理各地的民政事務(wù)，安撫民眾，蠲免錢糧、恢復(fù)生產(chǎn)。并且下令各地駐軍均不得擾民。
    同時洪承疇又向湖南、江西、安徽各省發(fā)檄進行招撫，只要是向清軍投降，原官、司均可留任，并不念舊故。并且又嚴令耿仲明、尚可喜等人，凡事主動向清軍歸降的各州府縣，均不得侵撓劫掠，當(dāng)以安撫為主。
    不過對商家軍的措秩則是實行全面封鎖，洪承疇要求，在浙江、江北、山東地區(qū)，完全封鎖住雙方的邊境線，絕對禁止有人通過邊境，和商家軍聯(lián)糸，也嚴禁商販前往商家軍的地區(qū)經(jīng)商。一經(jīng)發(fā)現(xiàn)，必然嚴懲。
    因為洪承疇了解到，現(xiàn)在商毅的主要財政來源是依靠海外的貿(mào)易收入，僅靠浙江一省的生產(chǎn)，根本就支持不了商家軍的戰(zhàn)事開支。但進行海外貿(mào)易，需要靠內(nèi)陸提供大量的商品，才能為海外貿(mào)易保障充足的貨源。盡管現(xiàn)在浙江可以自行生產(chǎn)大量的生絲和絲綢，但其他商品也都需要從內(nèi)陸購進，為了吸引商人，浙江地區(qū)己經(jīng)將商品的收購價格提高了三倍。
    為了追求大的利潤，在商家軍和清軍對持的時候，乃然有許多商人冒險將各種商品，穿過清軍占領(lǐng)地區(qū)，運到浙江來販買。當(dāng)然在通過清軍防區(qū)的時後，商人都會向他們進奉大量的錢財進行賄賂。而這一筆錢自然也都落入了私人的腰包中，因此各地駐守的清軍對此也是睜一眼閉一眼，畢竟和錢過不去的人還是少數(shù)。而且商家軍安插在南京、江淮的情報人員，也主要是通過這些途徑，把情報消息傳入到浙江。
    洪承疇對這種現(xiàn)像當(dāng)然十分清楚，因此才下令必須全面斷絕，徹底浙江的商品供應(yīng)，雖然在短期內(nèi)效果不會太顯著，但時