0年代初“工程師“在帕萊斯蒂諾和奧希金斯執教期間也卓有成就，但執教曾六次奪得聯賽冠軍的智利大學隊的兩年經歷給“工程師“的執教能力蒙上了一層陰影。此后曼努埃爾帶領阿科斯塔和內斯托爾·果洛希托這兩位球星并在阿甲聯賽中連續兩次奪得亞軍，此外還在1994年的美洲洲際杯中捧起個人首次個人執教的冠軍獎杯，接下去一年里，“工程師“又在智利冠軍杯中得冠。
    “工程師“的一系列成就引起了厄瓜多爾基多體育大學隊的關注并于在1998年被球隊聘任為教練?！肮こ處煛昂芸鞄ьI球隊取得了首次聯賽冠軍。
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