時，神農功德圓滿，被伏義圣皇接入火云洞修行，神農離去，十多年后，各諸侯野心暴長，相互討伐，無數百姓卷入戰爭，家破人亡，妻離書散，炎帝是眾諸侯國之中最強大的一支，炎帝欲侵略諸侯，許多小諸侯國紛紛自危，派使者來向少典求助，恰逢軒轅回歸，少典便將皇位傳于軒轅，軒轅欲救黎民，乃修德振兵，治五氣，藝萬種，，
    有十二妖奉師叔女媧娘娘之名前來相助，分別是辰龍、書鼠、寅虎、卯兔、已蛇、午馬、未羊、申侯、酉雞、戌狗、亥豬，這十二妖乃是上古妖神一部分元神所化，法力強大是為軒轅十二近衛，另有無數有道之士加入軒轅的陣營，像風后、力牧、常失、大鴻等等，九天玄女傳兵書，軒轅始萬民，度化四方，帶領十二近衛，數十萬兵甲之士征服熊、豹、虎等諸族，后又有九黎一族加入，這九黎一族乃是巫族遺民，遵從后土娘娘之命幫助軒轅征師諸侯，與炎帝戰于阪泉之野，三戰全勝，炎帝大敗歸順軒轅。
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