火焰鳥和閃電鳥都被抓走，這樣一來就只剩下最后的急凍鳥了。
    巫馬對于三圣鳥被抓并沒有那么在意，他更在意的是這個擁有戰艦的人。這種戰艦光是從外表上來看就足夠壯觀了，而且他自身的力量還能夠毫不費力地捕捉三圣鳥，實在是有些恐怖。這樣一艘戰艦究竟會是什么人制造出來的呢。也不知道這件事和火箭隊有沒有關系。
    此時，暴雨已經停止了，改成了下雪。由于火焰鳥和閃電鳥都被抓了，急凍鳥正在占領其他兩只寶可夢的地盤。
    漸戰艦一直在空中追尋著急凍鳥。由于急凍鳥在不停地飛行，一時間也沒能夠追到。
    漸漸的，天亮了?？罩械臑踉葡?，露出了太陽。不過可以看到的是，海面上很大一部分區域都被冰給凍住了。
    戰艦終于追上了急凍鳥，開始對急凍鳥進行捕捉。
    在戰艦之中，小智也嘗試著將火焰鳥和閃電鳥救出來。小智誤打誤撞地用皮卡丘的電、噴火龍的火和杰尼龜的水融合到一起，制造出了氣體炸彈。
    氣體劇烈的爆炸，破壞解掉了火焰鳥身上的圓環。
    火焰鳥恢復自由后，對著閃電鳥噴出了火焰，將閃電鳥的金屬環也打碎了。
    兩只寶可夢一見面就打了起來。它們將戰艦打出了一個缺口，飛了出去。接著，它們不斷地進行對戰艦進行攻擊。戰艦都受到損傷，降落在了雷之島上。
    小智幾人及時地跑出去，也成功地拿到了雷屬性的寶石。
    三圣鳥相見之后，立刻發動了混戰，相互攻擊了起來。
    「大家快跑！」
    小智幾人坐上船，趕緊離開。
    就在這時，一道水龍卷忽然從海里沖了出來，卷起船只向著一個方向跑去。
    巫馬在旁邊看三圣鳥的戰斗，也不敢去插手。若是介入它們的戰斗，瞬間會被打成渣。
    水龍卷直接送著小智他們來到了神廟所在的島嶼上。在這里，他們遇到了一只河馬王。
    巫馬看到河馬王后，立刻飛了下來。
    河馬王招手說道：「將寶珠放在那邊?！?
    大家見到河馬王會說話非常的驚訝。不過見過會說話的喵喵后倒也很快接受了。
    小智也顧不得太多，拿起兩顆寶石跑到了神廟的祭臺上。祭臺上面有三個雕像，雕像分別對應著三座島嶼。
    在雕像中有一個承接寶珠的地方，小智將火之寶石和雷之寶石放入了其中。
    這時，河馬王忽然說道：「寶石還少了一個，看來你還需要去冰之島，將冰之寶石拿出來。想要平息三圣鳥的怒火，必須將三顆寶石放置在祭臺上，同時吹響海神之笛?！?
    就在這時，三圣鳥似乎感覺到了什么，全部向著神廟這邊飛了過來。它們對眾人發動了攻擊。
    在攻擊發出的時候，之前的水龍卷再度出現，將三圣鳥的攻擊擋住了。
    一道身影出現在大家的面前，它便是海之神洛奇亞。
    三圣鳥見到洛奇亞后，立刻對洛奇亞發動了攻擊。原本他們三個是混戰，現在有了一致的攻擊目標。
    洛奇亞升到高空，躲過了三圣鳥的攻擊，同時將它們引開。
    「小智，趕快去冰之島吧！」
    「好，我現在就去?！?
    小智坐在噴火龍身上，向著冰之島飛去。
    巫馬走到河馬王的旁邊，仔細地看著它。發現這只河馬王確實和常磐森林的不同。
    「你認識常磐森林的那只河馬王嗎？」巫馬詢問。
    河馬王一臉疑惑，回答道：「不認識。我一直都待在這里，沒有到其他地方去過。」
    「大家小心??！」小霞喊道。
    三圣鳥又重新飛了回來，洛奇亞卻不見了。
    洛奇亞的實力雖然很強，但同時對上三圣鳥也分身乏術，一不小心就被攻擊連續的命中，掉入了海里。
    三圣鳥對著神廟發動了攻擊，大家趕緊躲避。
    「去吧，急凍鳥、妖精獸、機械暴龍獸、神圣天使獸、惡魔獸、超比多獸。」
    巫馬將能夠飛行的精靈全部放了出來。六只精靈分成了三組，向著三圣鳥攻擊過去。
    只見三圣鳥中的急凍鳥忽然叫了一聲。巫馬的急凍鳥轉頭，對著超比多獸發動了攻擊。
    還好妖精獸及時地擋住了攻擊，不然超比多獸會受到重傷的。
    「回來吧，急凍鳥。」巫馬趕緊將急凍鳥收了回來，同時鎖死了精靈球。
    他沒想到三圣鳥的急凍鳥還可以命令其他的急凍鳥。
    「哈克龍，你去幫忙吧！」
    急凍鳥沒辦法上場，巫馬就只能讓哈克龍補上了。
    火焰鳥使用了噴射火焰。
    機械暴龍獸同樣使用火焰噴射火焰抵擋。但兩者的實力完全不是同一個個層次的，機械暴龍獸的火焰反而被火焰鳥控制了。
    「位元炸彈！」
    妖精獸使用位元炸彈擋在機械暴龍獸的前面，將火焰轉移走了。
    「究極破壞炮！」
    兩枚究極破壞炮發射過去，命中的火焰鳥。但對火焰鳥造成的傷害都不是很大。
    「天堂之門！」
    神圣天使獸在空中打開了天堂之