程越的命令送到中書后，真金高興得手舞足蹈，馬上就簽章批準。中書省上下士氣大振，一道道命令從中書省送出，上面都特別注明“中書令真金與中書左丞程越嚴令”的字樣，被火速送到各衙門。
    各衙門接到命令，不敢怠慢，全都緊急動員起來，衙門里面進行詳查，外面到處是抓人的捕快和差役。
    一個個大戶人家被敲開大門，一個個紈绔子弟被戴上鐐銬。大都豪強人人自危，對家人嚴加約束，百姓歡天喜地，紛紛鳴放鞭炮以示慶賀，以至于鞭炮的價格升了三倍！
    因禿魯麻被放出來的人又被抓走，大都的豪強當然要找喇嘛理論，但所有找到總制院的人都只能看到總制院緊閉的大門。任憑你隨意敲打，里面只一句話――閉門思過，莫要多言！
    中書省威勢大漲，尚書省樂得在一旁看熱鬧。整治這些人是真金一直以來的愿望，卻要靠程越才能達成，盡管如此，真金辦起事來仍然渾身是勁，根本不用程越操心。
    被抓的人自然要想辦法脫身，于是無論是忽必烈的案頭，還是朝中顯貴的身邊，求情請托的都絡繹不絕。
    忽必烈將接到的奏章一律留中不發，不聞不問。朝中顯貴中，即使是阿術、安童等人也不敢到程越那里去求情，以免被程越訓斥。
    中書省派不忽木負責開始重審被再次抓起來的紈绔子弟。在宮中的默許和真金和程越的鼎力支持下，不忽木沒受到多少阻撓，案子斷得很順利。將這些人全都重新下獄。博得百姓一片“青天”之聲
    李庭在大都城外幾天內抓獲外逃的喇嘛三百余名。因為總遇到反抗，先后打死一百多人，剩下的全都送進中書省大牢。
    嘉木揚喇勒智和另外幾個活佛的家被抄沒，搜出的金銀財物比嘉勒斡巴勒還要多幾倍，程越將這些錢送進中書，讓不忽木負責，用于對受到喇嘛荼毒的人進行賠償。
    依照藏傳佛教一貫的德性，從他們家中還搜出大量人骨和人皮制品。程越把它們放在中書省門口任人參觀。大都百姓看到后驚駭憤怒，一傳十，十傳百，參觀的人潮始終絡繹不絕，市井之中盡是咒罵抨擊之聲，紅教的名望進一步遭到打擊，大都的喇嘛如過街老鼠，不再受人尊重，反而漢人的釋教和道教更加得到尊崇，慢慢奪回往日的信眾。
    大都被遺棄的女子第二天就明顯變少。程越買下的鋪面并沒有住滿。畢竟大多數人并不希望家丑外揚，女子和孩子留在家中為奴為婢都可以。趕出家門未免可惜。
    張淑芳對被程越解救和先后來投奔的三千多名女子登記造冊，將她們分成若干組，由程越帶來的工匠教她們各種手藝，其中最主要的就是紡織羊絨和制造毛線。紡織業可以吸收大量人工，是最適合女子的職業之一。
    二月十三日，烏訥爾從蓮花寺清理出近六百具女子的尸身和一千余具嬰兒的尸體，裝棺后進大都繞了一圈，讓大都百姓親眼目睹喇嘛的殘暴。
    程越遂將整理出來的蓮花寺罪狀上奏忽必烈，請求誅殺一干人犯。
    忽必烈不愿殺掉這么多喇嘛，將奏章直接發回。
    程越當天即再上奏章，忽必烈再發回，程越又送，三次奏章言詞一遍比一遍激烈，不達目的，堅決不肯罷休。
    忽必烈非常為難，將程越的奏章發給朝中重臣詢問。阿術、伯顏、安童、真金、姚樞、不忽木、竇默、郝楨、許衡等先后上表支持，大批受到喇嘛侮辱的大將和中下級官員也上書附議。
    阿合馬沒有明確表態，但尚書省各部尚書、侍郎等上書他也不制止，尚書左丞張惠更是當廷贊同程越的奏章，震動朝野。
    忽必烈收到雪片般飛來的上書，幾乎全是一面倒地請求忽必烈誅殺喇嘛，連一向慈悲為懷的察必也力主嚴懲，南必和其他皇后、皇妃更是義憤填膺，忽必烈終于被說服。
    二月十七日，忽必烈準了程越的奏章，消息傳出，轟動大都，八思八正式上表請罪，被忽必烈慰留。百姓們敲鑼打鼓，大都四面一片歡騰，前往鎮南王府門口拜謝的百姓將街道都給堵住了。
    程越當即立斷，向真金請命后，下令第二天即處斬。
    二月十八日清晨，中書省四門洞開，一千多名喇嘛被從幾處大牢提出，由呂文煥、呂師夔、范文虎押解，浩浩蕩蕩地被押往鐘鼓樓刑場。
    大都百姓全城出動，蜂擁而至，將整個鐘鼓樓的四條大道圍得水泄不通，比過年還要熱鬧好幾倍。
    就在一個多月前，鎮南王程越在這里當街割了八思八國師弟子的雙耳，僅僅不過一個多月，當初被鎮南王親自送往蓮花寺的活佛和八思八國師座下的幾位活佛還有一千多名喇嘛全都要在此地被處死！這是何等的大快人心！
    被押解的喇嘛們再不見了往日的風光，個個縮著脖子滿臉的可憐相，有的喇嘛試圖裝出視死如歸的樣子，但面對死亡的恐懼不是輕易就可以掩蓋的。
    大都的百姓對被他們毫不客氣，不顧喇嘛的哀號，爭先恐后地用石頭去砸他們，負責押解的軍士也恍若未見，被打得昏死過去的比比皆是，用馬拖著就走。
    百姓們見無人制止，下手更狠，從中書省到鐘鼓樓喇嘛們受傷無數，竟然還有幾個喇嘛被活活