袁術在壽春得知孫策擊走劉繇（yáo），上表奏請孫策為殄寇將軍，把吳景、孫賁、周尚等人召回壽春留為已用。派其堂弟袁胤（yì
    ）取代周尚任丹陽太守，周瑜隨周尚到了壽春（今安徽壽縣）。袁術發現周瑜有才，便欲收羅周瑜為已將。
    周瑜看出袁術最終不會有什么成就，所以只請求做居巢縣長，欲等待機會投奔孫策，袁術同意了周瑜的請求。
    …………
    孫策繼續進攻江東各地。
    當時吳人嚴白虎等各萬余人，處處屯聚。
    吳景等欲先擊破嚴白虎等。
    孫策說：“虎等群盜，非有大志，此成禽耳。”
    于是引兵渡過浙江，直逼會稽。
    會稽功曹虞翻勸太守王朗暫避孫策的鋒芒，王朗不聽，發在固陵（浙江蕭山縣西）阻擊孫策。
    孫策幾次發動進攻，均未能奏效。孫策的叔父孫靜獻策，建議聲東擊西，從查瀆進兵，出其不意，攻其不備，孫策依計。
    于是，夜里一面到處點燃火把，迷惑、牽制正面之敵，一面分出兵馬悄悄從查瀆出擊。王朗出于意外，大驚，派周昕率兵倉猝迎戰，孫策斬殺周昕，長驅直入。
    王朗敗潰，帶虞翻乘船逃到東冶（今福建福州）。
    孫策派賀齊追擊，王朗投降，孫策派張昭勸王朗投靠他，但王朗不肯，后來朝廷征召王朗，孫策將王朗送至許都。
    孫策以朋友的禮節親自拜訪虞翻，虞翻投歸孫策，被重新任為會稽功曹，于是會稽平定。
    同年，孫策開始向漢廷貢獻禮物。
    …………
    建安二年（197年），袁術占有傳國玉璽正式僭越稱帝，孫策給袁術書信，勸喻其不可，袁術不聽所勸，兩人于是絕交不再有往來。孫策還發書信勸說吳景、孫賁、孫香等親戚與袁術決裂，返回江東。
    袁術有稱帝之心，早就向家人披露過他的心跡，他的嫁給孫策的女兒袁淼也知道。
    袁淼自以為自己不久就是皇帝的女兒公主了，所以，在張維宜的家里逐漸顯露出專橫跋扈的脾性來，不僅和孫策的原配處的不好，和孫策的另外兩個妾室也處得不好。
    孫策得知，一封休書，把袁淼休回了家中，再以后，沒有文字提及袁術的這個女兒，她也沒有給孫策留下后代。
    …………
    曹操派議郎王浦攜帶漢獻帝的詔書給孫策，任命他為騎都尉，襲父爵烏程侯，兼任會稽太守，并命他與呂布、陳瑀（yǔ）等一起討伐袁術。
    孫策覺得自己統領兵馬，騎都尉的職務有點低了，想得到個將軍的封號以自重。派人向王浦微露其意。王浦當即以皇帝的名義宣布孫策權代明漢將軍。
    當時，陳瑀軍駐海西（今江蘇東海），孫策按詔書要求，整頓兵馬，要去與呂布、陳瑀會面，謀劃軍機，參同形勢。但他率軍走到錢塘時，情況卻發生了變化。
    原來，陳瑀想要乘機奪取孫策的地盤。
    他派人秘密渡江，拿著三十多個印信給各地散寇及諸險縣大帥，讓他們作內應，等孫策的部隊一開拔，馬上攻取他的郡縣。
    孫策發現這一陰謀，大怒，派呂范、徐逸統兵直撲海西，大破陳瑀，俘獲他的將士、妻兒等共四千多人。
    孫策占有陳瑀的一個小妾白氏，隨軍。
    陳瑀往北逃奔袁紹。
    孫策親自率軍擊破當地的鄒倫、錢銅、王晟、嚴白虎等多處割據勢力，于是吳郡平定。
    袁術對孫策反對他稱帝十分惱怒，便拉攏丹陽的祖郎等地方勢力，并鼓動山越共同對付孫策。而太史慈也占據涇縣，自稱為丹陽太守。
    建安三年（198年），孫策派徐琨趕走袁術所派的丹陽太守袁胤，平定宣城以東各地，迎接剛從袁術處回來的吳景擔任丹陽太守，之后孫策親自進攻丹陽涇縣以西。他先進擊陵陽（今安徽青陽縣東南），擒獲祖郎，又進擊勇里（今安徽涇縣西北），擒獲太史慈。
    孫策平定丹陽回師的時候以太史慈、祖郎二人領軍為先導，全軍都感到十分榮耀。
    回吳郡后孫策拜太史慈為折沖中郎將，授祖郎為門下賊曹。于是丹陽平定。
    這時，袁術之前任命的周瑜為居巢長，魯肅為東郡長，但二人知袁術難成大器，在孫策平定丹陽時相繼棄官渡江來投奔孫策，孫策親往迎接周瑜，拜建威中郎將，當即給周瑜增兵二千人，騎五十匹。又給周瑜鼓吹等軍用樂隊，興建府院住處，所贈賜的東西在軍中無人能比。
    周瑜引見魯肅，孫策對魯肅的才能十分驚奇，正準備任用時恰逢魯肅的祖母去世，魯肅送祖母的靈柩回東城安葬治喪。
    孫策又向漢廷貢獻禮物，規模是建安元年（196年）的兩倍。
    漢廷任命他為討逆將軍，封為吳侯。
    …………
    建安四年（199年），孫策得知劉繇逝去的消息，太史慈提議為孫策招降劉繇殘兵，二人約定六十日內完成任務，于是孫策派太史慈前去招降劉繇余下的一萬多士眾。
    當時群臣皆認為不可相信才剛投效的太史慈，但孫策力排眾議，堅持相信太史慈。
    太史慈果然招降了其劉繇